一、消毒防病
孵化管理除了调控水质、控制水流量、检查、清除污物外，最主要的就是做好消毒防病工作。应对孵化设备进行消毒，受精卵移入孵化槽前应消毒，在孵化过程中每1～2天用药一次，直至出膜为止，用药应均匀。使用时避免长期使用同一种药物，以防产生抗药性。每天翻动卵块2～3次，如发现有卵块感病，应立即移出。未受精卵和死亡的鱼卵易感染真菌，卵块表面会出现白色或褐色的棉絮状物，真菌也易感染健康鱼卵，应立即用福尔马林浸泡消毒，但在出膜前一天不能用福尔马林处理。
斑点叉尾鮰鱼卵、鱼苗和鱼种常用化学消毒剂：
1、病症：卵上的细菌；消毒剂：①3毫克/升的高锰酸钾；②25毫克/升的土霉素。
2、病症：卵上的真菌；消毒剂：100毫克/升的福尔马林（37％甲醛溶液）浸泡15分钟，然后冲洗。
3、病症：苗种感染细菌；消毒剂：①3毫克/升的吖啶黄素，不限时间，或100毫克/升，1小时。②20毫克/升的土霉素，喂药饵，3克/千克饲料，连喂10～14天。
4、病症：原生动物寄生；消毒剂：①5～1.0毫克/升的硫酸铜；②3毫克/升的高锰酸钾，不限时间，或10毫克/升，1小时（防车轮虫）。
5、病症：其他体外寄生虫或真菌病；消毒剂：①25毫克/升的福尔马林，不限时间，或100～200毫克/升，1小时；②1％～3％食盐溶液，直至出现应激反应（约1分钟）。
二、孵化水温
卵的最适孵化温度为26～28℃，水温低于20℃或高于30℃时都会降低孵化率。该鱼喜欢在弱光下孵化，孵化设施应设在室内。一般26℃左右的水温7～8天鱼苗即可出膜，水温稍低或稍高，孵化时间将延长或减少一天。孵出的鱼苗在水体的底部聚集成团，此时的卵黄苗靠卵黄囊提供营养，约3天后即可开食，并开始上浮，此时称之为上浮苗，体色由粉红色变为亮黑色。当上浮苗达1/3时，开始投饲，每天投喂8次，使用全价破碎料。
三、胚胎发育历程（26℃）
1、受精1天：心脏尚未搏动。
2、孵化1～2天：心脏搏动。
3、孵化2～3天：血痕出现。
4、孵化3～4天：血液开始流动。
5、孵化4～5天：眼点出现。
6、孵化5～6天：眼点明显，胚胎位于卵膜内层。
7、孵化6～7天：可见鱼体全形，血痕消失。
8、孵化7～8天：开始出膜。
鱼卵孵化采用相应类似原理设计的孵化设施均应考虑到水体的变换量，溶氧应达到5毫克/升以上，水质保持清新，易于集苗，并设有防苗逃逸设施。
