一、微生物制剂的作用原理
微生物制剂的作用原理：将有益微生物制剂添加到养殖水体中，补充养殖水体中缺少的菌类结构，维持微生物群落之间的生长平衡，促进养殖水体中的有机物质的分解循环，保持水体生态系统的健康发展；有益微生物制剂对有害微生物需求的氧气和生长位点进行竞争，来起到抑制有害微生物的生长；部分有益微生物的产物能提高水产动物的免疫力。
二、微生物制剂与其他药物相比的优劣势
A：微生物制剂的优点
2.1绿色健康副作用小
微生物制剂中的有益微生物在大量增殖后，生物之间的竞争氧气，养料和物种之间的压制下能有效抑制有害微生物的生长，以及通过有益微生物的摄食分解能降解有害理化物质的含量，这些过程对水产动物基本没有影响，也没有药物残留和副作用，可以长期使用，绿色健康。
2.2作用效果较彻底
使用微生物制剂后，有益微生物在池塘环境中一代又一代的繁殖和生长，不停的对池塘底质和水体中的超标物质进行改良，优化水体中的藻相结构和抑制有害微生物的生长来调水防病，因此有益微生物菌作用的时间较长，作用效果比较明显。
2.3功能全面
有益微生物菌不仅可以消除池塘中超标的氨氮、亚硝酸、硫化氢等危害的物质，对促进藻类的生长以及优化藻类的藻相组成也有重要作用，还可以提高饲料的利用率，以及防病治病等，功能强大且全面。
2.4能提高水产动物免疫和品质
微生物制剂中的有益微生物可以直接泼洒在水体中也可以拌饵投喂，即对水体环境有改良作用，也可以被水产动物摄食消化，并且有含量较高的蛋白和微量元素，对水产动物的免疫能力和水产动物的肉质有明显的提高。
B：微生物制剂的缺点
2.1使用后见效慢且要长期使用
微生物制剂的主要成分就是有益菌类，这些有益细菌在到达池塘后不会马上发挥作用，因为这些有益细菌数量太少，在面对有害微生物强大的攻击下作用有限，只有长期使用微生物制剂，将微生物制剂中有益微生物在水体中的含量培养到足够密度的情况下，才能将有效抑制有害微生物的生长繁殖，所以，使用微生物制剂要有个长期的过程才能见到效果。这对于池塘急需解决的问题来说，水产养殖动物怕等不到这么长的周期。
2.2品质参差不齐
水产微生物制剂是最近几十年才发展起来的一种水产养殖保健用品，不论是对于研究机构还是养殖者个人来说都是认识较为有限，研究的深度远远不够，也由于这些年微生物制剂的神话论导致很多不良水产药品公司粗制滥造，也有很多微生物制剂生产或者销售的个人或集体不懂得微生物的保存，导致微生物菌死亡，这些微生物制剂的品质令人担忧，市场上的产品也是层次不齐带来较大的风险。
2.3投入成本略大
微生物制剂生产难度比一般水产药物生产难度大，因此销售价格也比较贵。在水产养殖过程中，微生物制剂的使用是一个长期的过程，需要定期补充微生物的数量才能达到作用效果，这就给使用者带来较大的采购和人工成本。
2.4使用方式较复杂
很多微生物制剂是需要提前激活才能使用的，不然使用效果会大打折扣，比如光合细菌和芽孢杆菌需要使用红糖水激活扩繁才能下池。使用时要注意增氧，微生物下池容易导致缺氧。微生物制剂最好耗氧不耗氧的菌类结合，分解有机物的和吸收无机物的结合，改底的和调水的结合这样才能使效果更佳明显，单一使用效果较一般。因此只有懂的微生物制剂的原理的使用者才能充分发挥微生物制剂的功能。
红糖
2.5使用条件不当作用适得其反
微生物制剂要在晴天上午有微风的条件下使用，不然会加重缺氧。微生物制剂使用过量会导致水体无机营养盐释放过量，导致藻类疯长。微生物制剂有的载体物含有丰富的营养物质，大量使用也会加重水体中的富营养程度。
水体富营养化
2.6发挥效果的条件非常严苛
·微生物制剂通俗的来说也是一种细菌，它们和普通细菌一样。都害怕杀菌剂，杀菌剂有各类的抗生素、消毒剂、氧化剂等。
漂白粉
·微生物制剂也害怕水过瘦或者过肥，水过瘦和过肥都不利于有益菌的生长，效果自然难发挥出来。
·微生物制剂只有在酸碱度适中、水温条件合适、盐度合适、有机质含量适中、透明度适中、有害重金属、水深条件合适、使用频率适中、菌种选择正确等等一系列条件合适下才能发挥其功能。
