1、气温水温太低
不同的藻类对温度的需求也有所不同，过低的温度新陈代谢慢，藻类起不来。
2、光照时间不够
阴雨天光照不足或温度低，藻类生长繁殖速度慢，一般连续两天晴天，水就可以肥起来。
3、缺乏藻种
把老塘藻相较好的水引进，或者用氨基酸精华素等含有藻种的产品。
4、缺乏藻类必需的营养元素
5、青苔丝藻等大型藻类或者杂藻过多
青苔丝藻过多的话不能肥水，因为大型藻类能够与小型藻类竞争营养物质，抑制单胞藻的繁殖和生长。此时肥水不但肥不起来还会使大型藻类大量繁殖，从而水更不好肥。
6、浮游动物（原生动物、枝角、轮虫等）过多
浮游动物（原生动物、枝角、轮虫等）过多的话，肥起来的小型藻类都被浮游动物所摄食
7、水体残留毒素（药物残留、重金属残留等）过多
过量使用毒副作用较大的消毒剂或重金属浓度过高将藻类和微生物杀灭而导致其无法繁殖和生长，可以先解毒后肥水。（有时候甚至解两遍、三遍毒才能肥起来）
8、PH过高或者过低
9、新开挖的池塘或者渗水比较严重的池塘肥水也不好肥
新开挖的池塘渗水比较严重，水质不稳定，水中的营养元素都随渗出的水流失，所以肥水不好肥。
10、水体比较浑浊
水中的悬浮物过多的话用在水中的营养元素都被悬浮物吸附从而不能被藻类所吸收，所以水肥不起来
11、水体有机质过多
水中有机质过多不分解就会使藻类缺乏营养元素。有机质过多还会造成水体透明度减小，氨氮，亚盐偏高，底质有机质发生厌氧分解，有害菌滋生等现象。可以先用吸附性的产品将过多的有机质吸附到塘底，再进行改底。有机质过多要注意增氧，防止浮头。
12、螺丝太多（主要蟹塘）
螺丝太多会吃掉大量的藻类，使水变瘦。螺丝太少或者小野杂鱼过多会引起水质浑浊，也能使肥水不好肥。
