生物过滤是指采用活体生物去除水中杂质的废水处理技术，主要包括植物过滤、微生物过滤、动物过滤等。
目前集约化水产养殖水处理中使用最广泛的是微生物过滤，即各种类型的生物膜滤器。传统的生物膜滤器因具有产生污泥少、运行管理方便、动力消耗少等特点，在水产养殖废水处理中得到了广泛应用。但生物膜滤器存在生物膜熟化时间长，需要定期反冲洗，容易造成硝态氮积累等缺点。
植物滤器结构简单，可以有效吸收养殖废水中溶解态的氮、磷污染物，并将其转化为经济产品，但是单独使用对养殖废水中有机物去除效率较低。
滤食性动物可以有效去除养殖水体中的颗粒物质。
大型海藻过滤、生物膜过滤和动物过滤复合处理养殖循环水技术通过优势互补，可达到水质净化和废物综合利用的目的。复合生物过滤技术具有以下特点：
(1)提高水产养殖废水中氨氮和有机物的去除效率，弥补使用复合生物滤器的缺点。如微生物滤器生物膜成熟时间长，需要定期进行反冲洗，此时植物滤器可以替代其功能保持系统的正常运转..
(2)提高闭合水产养殖系统的生产力。利用复合生物过滤技术净化养殖废水，可最大限度地将投入系统的饵料转化为环境友好的水产品，会产生一定的经济效益和生态效益。
(3)实现真正意义上的“养殖污水零排放”，成功解决养殖循环系统中硝酸盐的积累问题。
(4)为养殖循环水提供新鲜氧气，减少能源消耗，降低生产成本。因此，复合生物过滤技术在水产养殖水处理中具有广阔的应用前景。
