提高水库的初级生产力，实际上是科学培育和提高水体浮游植物的生产力。浮游植物利用太阳能进行光合作用，既增加水中溶氧量，又繁殖成为滤食性鱼类和浮游动物、底栖生物的天然饵料，形成水体各种生产力的基础，与水库养鱼产量关系极为密切。
在温度、光照等条件适宜时，浮游植物的生产量主要受养分(氮、磷、钾三要素)的限制。在自然条件下，养殖水域的营养盐往往不足，必须靠人工施肥才能满足。水库的水域宽阔，大水体施用化肥养鱼是比较科学的方法，因为施用化肥后养殖水域中的浮游植物便很快大量繁殖，提高了水域初级生产力，从而为鱼类提供大量的饵料生物，提高了渔业生产力。
1.肥料效率
目前化肥养鱼大多采取尿素、碳酸氢铵、过磷酸钙或钙镁磷肥混合使用。肥料效率一般为0.5～1，高者可达到1～2。有的成鱼塘施入1千克尿素和2千克过磷酸钙，可生产2～5千克鲢鱼、鳙鱼；施入1千克碳酸氢铵和1千克过磷酸钙，可生产1～1.25千克鲢鱼、鳙鱼；施入1千克氨水，可生产0.5千克鲢鱼、鳙鱼。如果巧施化肥，1千克化肥可增产1千克鱼。据试验，施化肥的鱼塘要比没有施过化肥的鱼塘增产40%，经济效益增加30%以上。
2.技术要点
①养鱼常用的化肥，氮素肥主要有氨水、碳酸氢铵、氯化铵、硫酸铵、尿素，磷素化肥主要有钙镁磷肥、过磷酸钙、三料过磷酸钙。其中氮素肥以碳酸氢铵、氯化铵，磷素化肥以过磷酸钙养鱼效果较好。
②根据水库运行规律，每年5月中旬至10月底为化肥养鱼高效期。水温25～32℃时，浮游植物一般在施肥后2～3天出现繁殖高峰，4～5天后，浮游植物量随着营养盐类的减少而下降。
③化肥用量与水温有着密切的关系。一般池塘水温在17～20℃时，10～15天施化肥1次，每667平方米用量为5～6.5千克；20～25℃时，7～10天施化肥1次，每667平方米用量为4～5千克；25～32℃时，5～7天施化肥1次，每667平方米用量为3千克。一般施尿素0.5千克则配合过磷酸钙1～1.25千克；施碳酸铵0.5千克则配合过磷酸钙0.5千克。氮、磷的配比是1∶1，不少于1∶0.5。氮肥与磷肥混合使用效果较好。水库施肥总的原则是比池塘施肥的水平低些，应实行“量少勤施，瘦水多施，肥水少施”的原则。
④施肥要选择晴天，在上午9时至下午2时施入均可。这个时间段浮游植物的光合作用较强，化肥可以较快地被吸收利用。
⑤化肥必须搀水溶化后施入，不可直接以干品抛撒入水中，否则会引起肥料沉淀，被淤泥吸附而影响肥效。每次施用氮、磷化肥时，先将化肥溶于20～30倍水中，拌成肥液。必须注意，钙镁磷肥与碳酸氢铵混合使用时，须先溶化磷肥，然后溶化氮肥，次序不可颠倒。
⑥配制好的肥液，一般泼洒在水库3米深以内的浅滩处或库湾、消落区，尽量避开溢洪道口和放水闸门，以减少肥料流失。在水库排水高峰期和汛期，抢晴天将肥液泼施在上游，如遇天气闷热或连续阴雨天应停施。每隔10～15天投施生石灰1次，以调节水质。
