在藻类生物中，蓝藻是简单、原始的单细胞生物，没有细胞核，通常呈颗粒状或网状，色素均匀分布在细胞质中。在气温较高、光照较好、水温25—35℃时，蓝藻生长迅速，比其他藻类快。蓝藻繁殖很快，可以在2－3天布满整个池塘，夜间水中溶氧会被蓝藻大量消耗，如遇到天气突变，藻类会因氧气不足而大量死亡。当蓝藻死亡后，会产生大量的羟胺及硫化氢等有毒有害物质，这些物质在水中积累多了就会引起鱼类中毒死亡。蓝藻中的项圈藻可快速产生致死因子蓝藻素，破坏养殖对象的鳃组织，干扰其新陈代谢的正常进行，麻痹神经，使其死亡。养殖水体富营养化，蓝藻比较容易生长，不能换水的池塘往往更容易暴发蓝藻。有机磷是蓝藻生长的必须因素，治理蓝藻最根本的办法就是去除有机磷，可全池泼洒沸石粉10公斤一亩，平衡氮磷比例。
蓝藻的防控基本要领：
一、生石灰清塘。生过蓝藻的池塘，干塘后，用生石灰每亩100千克全池泼洒，这样能有效抑制蓝藻繁殖。
二、调控水质。经常使用微生物制剂调水，如EM菌、芽孢杆菌、小球藻等，使有益藻类得到大量繁殖，培育绿藻和硅藻等有益藻类快速生长成为优势藻种来抑制蓝藻生长，只要“藻相”平衡，有害藻就不会大量繁殖。使用微生物制剂过程中注意防止池塘缺氧，应选择连续晴好天气使用，使用后应开启增氧机两小时以上。
三、科学投饵。当养殖对象进入吃食生长的旺季时，大量投饵使水体中的残饵和养殖对象排泄物增多，而使水体富营养化，有蓝藻的池塘，这时就很容易爆发，对水质的管理和病害防治带来困难。要做到根据天气和吃食情况合理投饵，经常调整投饵量，尽量避免饵料过剩。通过使用底改药物改善底质，并调控水质。
四、药物控制。对已发生蓝藻的塘口，最好使用生物性药物控制，不能全池使用化学性铜类药物，因为化学性药物会将有益藻类、有害藻类全部杀灭，形成“倒藻”，引起缺氧浮头，而且使底质恶化，引发应激中毒。可在下风边蓝藻聚集处局部使用强氯精等药物杀灭，再用解毒剂解除死藻毒性。
总之，控制蓝藻的发生最根本的是要平衡氮磷比例，合理使用肥水、调水产品，适时培育绿藻和硅藻等有益藻类，成为优势藻种来抑制蓝藻生长，从而改变蓝藻过度繁殖的状况，达到控制蓝藻爆发的目的。
